Dr hab. inż. Marcin Jagoda jest autorem wielu artykułów naukowych w czasopismach o zasięgu międzynarodowym. Realizował granty badawcze finansowane przez Narodowe Centrum Nauki.
W pracy naukowej zajmuje się analizą zjawisk związanych z dynamiką globu ziemskiego na podstawie danych dostarczanych przez satelitarne i kosmiczne techniki obserwacyjne.
Prace badawcze prowadzi dwutorowo, koncentrując się na „elastycznej reakcji” Ziemi na naprężenia pływowe oraz na przemieszczaniach płyt tektonicznych.
Stopień doktora habilitowanego nauk inżynieryjno-technicznych w dyscyplinie inżynieria lądowa, geodezja i transport uzyskał w dniu 21 lutego 2023 roku w drodze uchwały Rady Naukowej Dyscypliny inżynieria lądowa, geodezja i transport Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego w Olsztynie.